水冷式冷凝器所用的冷卻水在循環使用過程中，由于溫升、濃縮和蒸發等原因，循環水內的碳酸氫鈣和碳酸氫鎂中的二氧化碳逸出，將分解生成碳酸鈣和碳酸鎂。它們的溶解度很低，從水中分離出來，沉積在冷卻器或管道內壁形成水垢，時間越長，垢層越厚。另外，冷卻水經冷卻塔時混入了空氣中的塵土和細菌，也會使冷卻設備和管通的內壁形成泥垢等。
冷凝器表面的水垢與雜質使冷卻水管的直徑減小，水量減少。水垢的傳熱阻較大，使冷凝器的換熱效率明顯下降，冷凝壓力和溫度升高，壓縮機的制冷量降低。因此，必須定期進行除垢，清洗的周期則視冷卻水的具體條件而定，一般1~3年進行一次，使用深井水冷卻時也可每年清除一次。
1)水冷式冷凝器的手工除垢
將殼管式冷凝器兩端的鑄鐵端蓋拆下，用螺旋形鋼絲刷伸入冷卻管內，往復拉刷，然后再將接近針子內徑尺寸的麻花鋼筋塞進冷卻管內反復拉捅，一邊捅一邊用壓力水沖洗。
2)水冷式冷凝器的電動機械除垢
將臥式水冷式冷凝器的端蓋打開，立式水冷式冷凝器將上邊的檔水板拿掉，用專用刮刀接在鋼絲軟軸上，另一端接在電動機軸上。將刮刀以水平或垂直方向插入冷卻管內，開動電動機就可刮除水垢，同時用水管沖洗刮下的水垢并冷卻刮刀，應注意冷凝器的焊口或脹口，以防振動而出現泄漏。圖7-4所示為鉸錐式刀頭在管內清除水垢的情形。
除垢所用的全套清理工具包括鉸錐式刀頭、銑輪式刀頭和機械刷子等三種。鉸錐式刀頭的結構如圖7-5所示，它一般被加工成3~6個圓弧形齒或螺旋形齒，其外徑比被除垢管子的內徑小5~10mm。刀頭用鑄鋼制成，刀頭底部有螺紋，可與萬向聯軸器相連接。由于軟軸高速轉動，刀頭將做錐形運動，并且具有很大的離心力.對積垢進行刮削和沖擊，使積垢脫落下來。由此可見，同一刀頭可以清除公稱直徑相接近的幾種管子。這種除垢方法不適用于銅管冷凝器，但對鋼管沒有損傷。應根據管內結垢厚度、銹蝕程度等情況來確定所選用刀頭的直徑，首次除垢時所選用的刀頭直徑比冷凝水管內徑適當小一些，以防損傷管壁，然后再選用與冷凝管內徑接近的刀頭再次除垢，這樣可除掉95%以上的水垢、污銹。
